审讯开始，御史率先发难，呈上所谓的“物证”——采购劣质鱼鳔胶的账目副本，以及几块标着刘能匠坊编号、却明显粗制滥造的竹材构件。
“大人明鉴！此账目清晰记录叶安于上月十五，采购劣质鱼鳔胶五十桶，远超市价，其中必有贪墨！”
“此竹材构件，强度低劣，一掰即断，却混入了供应兵部的军械辅件订单，若非发现及时，恐酿成大祸！人证物证俱在，请大人严惩！”御史言辞凿凿。
叶安连连叩头喊冤：“大人！冤枉！上月十五，卑职奉命去京郊查验新竹材，根本不在院中，如何采购？此账目定是伪造！”
刘能也急声道：“大人！这竹材绝非人所出！饶匠坊，每块竹材皆有独有印记和编号，用的是格物院特制的印泥和刻刀，深浅、格式皆有定规！请大人细看这物证上的编号，刻痕生涩，格式也不对！”
王朗安排的“证人”——一个被收买的格物院前吏和一个所谓“受害”的兵部官——也上场做了伪证，指认叶安平日行为不端，以及刘能匠坊以次充好。
形势对叶明一方极为不利。堂上三位主审官面色凝重，周正渊更是多次看向叶明，似乎在等他如何应对。
王朗见状，心中得意，出言道：“周大人，人证物证确凿，叶安、刘能罪责难逃。而叶院判身为格物院主官，御下不严，亦有失察之过！”
就在此时，叶明缓缓站起身，向堂上三位主审官躬身一礼：“三位大人，可否容下官询问几句？”
周正渊点零头：“叶院判请讲。”
叶明走到堂中，先拿起那本“账目”，仔细翻看了一下，然后转向那个做伪证的格物院前吏，语气平和：“你你亲眼见到叶司库签署这份采购单？”
“是……是的！”那吏有些心虚地低下头。
“签署日期是上月十五？”
“是！”
叶明不再看他，转向周正渊：“周大人，格物院自成立之初，便设有行程记录。”
“所有官员、吏员因公外出，皆需报备行程、时间、事由，并有相关人员签字确认。下官已将格物院上月所有的行程记录簿带来，请大人过目。”
他示意石柱将几本厚厚的册子呈上。
周正渊示意衙役接过，当堂翻阅。
很快，便找到了上月十五的记录，上面明确写着：司库叶安，辰时出，酉时归，事由：京郊竹园查验新竹材。后面还有同行两名匠饶签字画押。
叶明又对那名兵部官问道：“你你接收的这批‘次品’竹材，是直接由刘能匠坊灾兵部库房的？”
“是……是的！”
“何时？何人押运？可有交接文书？”
那官被问得有些慌乱：“是……是上月廿三，刘坊主亲自押运，文书……文书一时找不到了……”
叶明冷笑一声，不再理他，转身对周正渊道：“大人，刘能匠坊所有出货，均需通过格物院竹材监造司检验，合格后开具‘放行条’，方可运出。”
“监造司有所有出货记录、放行条存根以及承运车马行的记录。下官也已带来。”
“记录显示，上月廿三，刘能匠坊并无任何货物运往兵部！而兵部库房真正的收货记录，接收的是一批由‘张氏匠坊’出产、经监造司检验合格的竹材！”
此言一出，满堂皆惊！真正的账目和记录被拿出，伪证立刻显得漏洞百出。
“这……这不可能！”那兵部官脸色煞白。
王朗的心猛地一沉，暗叫不好。
叶明乘胜追击，拿起那块作为“物证”的次品竹材，朗声道：“三位大人，诸位请看！此物编号刻痕粗糙，格式错误，与我格物院规范迥异，此其一！”
“其二，真正的复合竹材，因其特殊工艺，断面竹纤维呈交错网状，坚韧异常。而此物，”
他双手用力一掰，那块竹材应声而断，断面整齐，纤维松散，“断面如此，分明是未经处理的普通竹片简单粘合！慈拙劣仿制品，也敢拿来构陷？！”
他将断开的竹材呈给三位主审官观看。周正渊等人仔细查验，对比叶明随后提供的真正格物院竹材样本，高下立判！
“其三！”叶明声音陡然提高，目光如电，扫向王朗和那名御史。
“下官已查明，伪造采购账目、仿造印章者，乃是一名左眉角有黑痣的管事！而此人，经查，正是王侍郎府上外院管事，王贵！”
“哗——！”堂外一片哗然！
“你……你血口喷人！”王朗猛地站起，脸色瞬间惨白如纸，指着叶明，手指都在颤抖。他万万没想到，叶明不仅查清了伪证，竟然连他府上的管事都挖了出来！
叶明毫不退缩，直视王朗：“王侍郎，若要人不知，除非己莫为！那王贵此刻想必已被大理寺的差官‘请’到了衙门外了吧？”
周正渊见状，猛地一拍惊堂木：“肃静！带人犯王贵！”
片刻后，一个面如土色、左眉角确有黑痣的中年人被押上堂来。
在确凿的证据和威严的审讯下，王贵很快崩溃，招认了受王朗指使，伪造账目、收买人证、调换物证，构陷叶安和刘能，意图打击格物院的全部罪校
真相大白！
王朗瘫软在地，面无人色。那名御史也吓得魂不附体，连连叩头求饶。
周正渊与另外两位主审官低声商议后，当庭宣判：“王贵伪造文书、构陷朝廷命官，罪证确凿，判斩立决！御史风闻不奏，受人指使，诬告忠良，革职查办！”
“王朗……身为朝廷重臣，心胸狭隘，指使家奴行此卑劣之事，危害社稷，着革去所有官职，押入牢，候旨发落！”
“叶安、刘能蒙冤受屈，当庭释放！格物院清誉得雪，叶明御下有方，查案有功，陛下面前，本官自当禀明！”
“大人明察！”叶明深深一揖。叶安和刘能更是喜极而泣，连连叩谢。
一场轰轰烈烈的三司会审，以叶明的全面胜利和王家的惨败收场。王朗被革职下狱的消息，如同一声惊雷，震撼了整个京城官场。
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