回到京城后，张川立刻启动紧急预案。他将西域遗迹的秘文与黑暗能量的情况，秘密禀报给皇帝。皇帝虽震惊，但对张川的信任早已根深蒂固，当即下令：全国灵植基地由玄甲卫接管，军工坊全力配合研发抗黑暗能量武器，各地官府密切监控灵植异常、野兽狂躁事件，一旦发现，立刻上报。
林雨柔的灵植技术研究院成为核心战场。她发现，灵源母液能强化灵植的正能量，让灵植拥有抵御黑暗能量的能力。于是，她将灵源母液稀释后，用于灵植基地的灌溉，培育出了 “觉醒灵植”—— 叶片泛着绿光，能量波动更强，不仅能抵御黑暗能量侵蚀，还能释放正能量场，净化周围的黑暗能量。
“觉醒灵植的正能量场，能让黑衣人失去战斗力。” 林雨柔在实验场演示，一株觉醒后的玄露草释放出绿色光幕，将之前捕获的黑衣人俘虏笼罩其郑俘虏瞬间痛苦嘶吼，身上的黑色能量逐渐消散，眼神恢复了一丝清明。
“太好了！” 赵灵儿兴奋地，“我们可以大面积种植觉醒灵植，构建防御网，让黑衣人无处遁形！”
苏婉儿则协调商盟，将觉醒灵植的种子分发到全国各大灵植基地，同时组织农户加急种植：“我已制定了‘灵植防御网’计划，在京城、江南、西域、南洋等关键地区，种植觉醒灵植带，形成交叉防御；灵植基地周围设置觉醒灵植屏障，防止黑衣人偷袭。”
张川则与军工坊合作，利用觉醒灵植的纤维和核心，研发抗黑暗能量武器：“灵植合金剑加入觉醒灵植核心粉末，能斩断黑暗能量波；灵植火炮填充觉醒灵植能量弹，能大范围净化黑暗能量；还有灵植护盾，用觉醒灵植纤维编织，能抵御黑暗能量侵蚀。”
研发过程中，苏婉儿的玉簪再次发挥作用。当她用玉簪触碰觉醒灵植核心时，灵植的正能量瞬间爆发，武器的抗黑暗能量效果提升了三倍。林雨柔推测：“苏姐姐的玉簪是灵源的衍生物，能引导和强化灵植正能量，是研发武器的关键。”
赵灵儿则带着玄甲卫，在全国范围内巡查灵植基地，指导防御建设，同时打击零星出现的黑衣人。一次，她在西北灵植基地遇到黑衣人偷袭，对方试图抢夺觉醒灵植核心。赵灵儿手持新研发的灵植合金剑，配合基地的觉醒灵植屏障，将黑衣人打得落花流水。
“你们这些藏头露尾的家伙，也敢来抢东西！” 赵灵儿一剑挑飞为首黑衣饶面具，露出一张熟悉的脸 —— 竟是之前被击败的匈奴残部首领！
“没想到吧，张川的走狗！” 匈奴首领狞笑道，“黑暗能量将赋予我们无穷的力量，我们会夺回西域，占领中原，让大明成为黑暗的领地！”
赵灵儿怒不可遏，灵植合金剑绿光暴涨，一剑刺穿了匈奴首领的胸膛：“痴心妄想！有我在，你们永远别想得逞！”
清理战场后，赵灵儿发现匈奴首领身上携带的黑色令牌，与之前河西走廊遇到的令牌纹路相同，只是等级更高。这明，匈奴残部已与那股神秘势力勾结，成为了黑暗能量的傀儡。
张川得知消息后，神色更加凝重：“匈奴残部只是棋子，背后的主谋还在暗处。我们必须加快进度，在他们发动大规模攻击前，完成全国防御网的建设，同时找到黑暗能量的核心，彻底摧毁它。”
三位红颜异口同声：“我们与你同在！”
深夜的王府书房，张川看着全国防御网的图纸，青铜碎片与玉簪在桌上泛着微光，觉醒灵植的样本散发着淡淡的绿光。他知道，这场战争注定艰难，但身边有三位红颜的陪伴与支持，有全国百姓的信任与努力，有灵源与文明的力量，他有信心战胜黑暗，守护这来之不易的盛世。
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