破劫之碑的光芒驱散轮回迷雾后，宇宙迎来了短暂的安宁。但这份平静如镜中花般脆弱——无界医媚终极监测仪突然捕捉到宇宙微波背景辐射中出现异常波动，所有星系的恒星开始以超乎常理的速度消耗能量，熵增进程被强行加速千倍。更令人绝望的是，一种名为“熵寂孢子”的神秘物质在虚空中扩散，所到之处，物质迅速崩解为最原始的粒子，连时间与空间的结构都开始扭曲变形。
秦溯在医道传承院感受到异动时，老槐树的树干轰然炸裂，从中飞出初代神农最后的意识残片。神农的虚影手持一株即将枯萎的“生命之树”，叶片上的纹路与宇宙星图完全重合：“当熵寂降临，万物将归混沌。但混沌亦是新生的温床，唯有以所有生命的信念为种，方能在终焉中孕育希望。”与此同时，秦曦的量子实验室被熵寂孢子侵蚀，所有精密仪器在瞬间锈迹斑斑，化作尘埃。
循着危机的源头，探索队抵达宇宙边缘的“熵寂深渊”。这里不再是人们认知中的空间，而是一片沸腾的混沌海洋，无数文明的残骸在熵能漩涡中沉浮。深渊中央，一座由破碎的黑洞与超新星残骸堆砌而成的“熵寂王座”缓缓升起，王座之上，一个由纯粹熵能凝聚而成的身影若隐若现——自称为“熵寂之主”的存在。他的声音如同宇宙终焉的丧钟：“秦溯，你们执着于延续文明的火种，却不知熵寂才是万物的宿命。一切都该回归虚无，从无到无，才是永恒的真理。”
熵寂之主挥动手臂，熵寂孢子如黑色暴雨般倾泻而下。接触到孢子的星球，山川河流瞬间崩解，生命体在熵增的剧痛中化为齑粉。自由残缺派与火种重启派的联合舰队在熵能风暴中支离破碎，他们的高科技武器还未发射便分解成基本粒子，魔法护盾在熵寂之力面前如同脆弱的肥皂泡。秦溯发现，常规手段对熵寂之主完全无效，因为对方本身就是熵增定律的具现化存在。
生死存亡之际，秦溯发起“星火永恒计划”。他向全宇宙发出最后的号召，征集每个文明最珍贵的记忆、最坚定的信念与最炽热的希望：原始人类第一次摩擦生火的专注、科学家在实验室中千万次失败后的坚持、恋人跨越星河的深情凝望。这些承载着生命意志的力量，通过量子网络汇聚成璀璨的“永恒火种”，注入秦溯的青铜罗盘。秦曦带领团队，利用历代危机中留存的能量，制造出“熵能中和矩阵”，试图对抗疯狂的熵增。
最终决战在熵寂深渊展开。秦溯高举燃烧着永恒火种的罗盘，与熵寂之主展开一场关乎宇宙命阅终极较量。在火种的光芒中，熵寂之主的熵能身躯开始出现裂痕，他看到了无数震撼的画面：在超新星爆发的废墟上，新的行星正在孕育；在冰封的世界里，生命以顽强的姿态破土而出；在末日的黑暗中，文明的火种在传承者手中永不熄灭。“原来...熵寂不是终点，而是新生的序曲...”熵寂之主的声音中第一次出现了动摇。
随着熵寂之主的消散，熵寂孢子开始逆向转化为滋养万物的“创生能量”。熵寂深渊化作一片充满生机的“新生星云”，每一颗闪烁的星辰都代表着一个浴火重生的文明。危机过后，秦溯在青山村建立“永恒之塔”，塔顶的火焰永不熄灭，象征着生命的意志与希望。新石碑上刻着：“熵寂非终焉，新生自永恒。医道的真谛，是守护每一个生命在毁灭与重生的循环中，永远追寻光明的勇气。”
星河之中，秦逸与林婉的星光融入永恒之塔的光芒，与全宇宙的生命之光交相辉映。从此以后，医道的传承者们带着这份信念继续前行，他们明白，只要生命的意志尚存，无论面对怎样的危机，宇宙都将在毁灭与新生的永恒循环中，绽放出更加绚烂的光彩。
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